O registro fóssil de cobras é relativamente pobre porque os esqueletos de cobra são tipicamente pequenos e frágeis tornando a fossilização incomum.
Os fósseis facilmente identificáveis como cobras (embora muitas vezes mantenham os membros posteriores) aparecem pela primeira vez no registro fóssil durante o período Cretáceo.
Os primeiros fósseis de serpentes verdadeiros conhecidos (membros do grupo da coroa Serpentes) provêm dos simoliófitos marinhos, sendo o mais antigo o Cretáceo Superior(idade Cenomaniana ) Haasiophis terrasanctus datado entre 112 e 94 milhões de anos . Com base na anatomia comparada , há consenso de que as cobras desciam dos lagartos .
Foi recentemente publicada um novo gênero e espécie de cobra proveniente da Guimarota (Leiria), Portugalophis lignites, que constitui um dos registos mais antigos deste grupo de vertebrados no registo fóssil. Portugalophis lignites viveu durante o estágio Kimmeridgiano do Jurássico Superior, entre 157 e 152 milhões de anos atrás. Seus fósseis foram descobertos em depósitos de carvão perto de Guimarota, Portugal. Foi encontrada numa mina perto de Leiria nos anos 1970. Daí viajou para a Alemanha, onde esteve até regressar a Portugal em 2008. Desde então tem sido estudada pela equipa de um paleontólogo canadiano, que agora a incluiu na lista dos fósseis de cobras mais antigos que se conhecem.
Eophis era um gênero inicial de cobra-caule (clade Ophidia ) contendo uma espécie, Eophis underwoodi , do Jurássico Médio (Bathonian) da Formação de Mármore Florestal do Reino Unido. Eophis é o primeiro membro conhecido do grupo ophidia.

Madtsoiidae é uma família extinta de cobras principalmente Gondwanan com um registro fóssil que se estende desde os primeiros estratos do Cenomaniano ( Cretáceo Superior ) até o Pleistoceno tardio, localizado na América do Sul , África ,Índia , Austrália e Europa do Sul. As cobras Madtsoid incluem cobras muito primitivas , que, como boas e pythons existentes, provavelmente despachariam sua presa por meio da constrição , como Gigantophis , uma das serpentes mais longas conhecidas a um valor estimado de 10,7 metros e o australiano Wonambi e Yurlunggur .

Najash é uma serpente basal extinta da Formação de Candeleros do Cretáceo Superior da Patagônia. Como uma série de outras serpentes cretáceas e vivas, manteve os membros posteriores, mas Najash é incomum em ter pernas bem desenvolvidas que se estendem para fora da caixa torácica e uma pelve conectada à coluna vertebral. Os fósseis de Najashforam encontrados na formação terrestre de Candeleros, na província do Rio Negro, na Argentina, e datam de cerca de 90 milhões de anos atrás.
Pythons e boas -primitive groups entre as cobras modernas - possuem membros traseiros vestigiais: dígitos minúsculos e de garras conhecidos como esporas anais , que são usados para agarrar durante o acasalamento.
As famílias Leptotyphlopidae e Typhlopidae também possuem remanescentes do cinto pélvico, aparecendo como projeções córneas quando visíveis.Existem mais de 2.900 espécies de cobras que variam tanto ao norte como o Círculo Ártico na Escandinávia e para o sul, através da Austrália.
As serpentes podem ser encontradas em todos os continentes, com exceção da Antártica, no mar e até 16 mil pés (4.900 m) nas montanhas do Himalaia da Ásia. Existem inúmeras ilhas das quais as cobras estão ausentes, como a Irlanda , a Islândia e a Nova Zelândia (embora as águas da Nova Zelândia sejam visitadas raramente pela cobra do mar de ventre amarelo e a krait do mar em banda ).

